El ENAM evalúa los conocimientos y su aplicación en las siguientes áreas, que se basan en las competencias esenciales del interno de medicina según ASPEFAM (Asociación Peruana de Facultades de Medicina):
Ciencias Básicas:
- Anatomía
- Fisiología
- Bioquímica
- Microbiología
- Patología
- Farmacología
Medicina Interna:
- Cardiología
- Gastroenterología
- Neumología
- Endocrinología
- Nefrología
- Reumatología
- Hematología
- Enfermedades Infecciosas
- Dermatología
- Neurología
Cirugía:
- Cirugía General
- Traumatología
- Urología
- Neurocirugía
- Oftalmología
- Otorrinolaringología
Pediatría:
- Neonatología
- Pediatría General
Ginecología y Obstetricia
Salud Pública:
- Epidemiología
- Bioestadística
- Administración y Gestión en Salud
- Medicina Preventiva
- Medicina Social
Psiquiatría
Es importante tener en cuenta que el ENAM se centra en la aplicación de estos conocimientos a través de casos clínicos y preguntas integradas. También evalúa aspectos éticos y médico-legales.